随着近年高等院校的不断增多，菲律宾高等教育委员会无法对每一所院校进行细致的监督管理，因此为了更好地执行其监管职责，高等教育委员会同意在私立高等院校中认定一批“自治”的或“解除管制”的学校。

“自治”和“解除管制”授予一贯在教育、研究和服务方面表现出色的私立院校，是通过改革对私立高等教育机构管制合理化的手段，体现了不同程度的高等教育机构的教学自治自由。比如，通过第一级认证获得批准班级和教师项目计划等管理方面的特权；通过第二级认证在管理和财政上完全被解除管制，部分课程获得自治权，可以重新修订，并且机构在申请补助方面有优先权等；通过第三级认证的私立院校不仅具有通过第二级认证的所有权力，而且在课程设置上完全被解除管制。

根据菲律宾的相关法律政策，被允许“自治”的高等教育机构拥有以下权利:不受限于一些特别规定；不受高等教育委员会监控和评估，但仍须向其提交所需数据；有机会获得某些特别项目的资助；有自由安排和决定课程的权力；通过备案，有权开设学位课程学习；通过备案，有权设立分校；有权建立与国外有关联的教育机构，提供远程教育。“解除管制”的自由程度低于“自治”，如“解除管制”的院校要实施以上最后两条的活动，则必须经过高等教育委员会的批准。